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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • mitochondrion 1
  • cytosol 3
  • plastid 2
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, nucleus, plastid
BaCelLo:nucleus
iPSORT:mitochondrion
MultiLoc:cytosol
PProwler:plastid
TargetP:plastid
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
KRH21073 Soybean cytosol 33.84 93.71
CDX77644 Canola cytosol 88.26 91.13
CDY43957 Canola cytosol 89.27 91.11
CDY33461 Canola cytosol 87.5 91.06
CDX87735 Canola cytosol 89.52 90.9
CDY03235 Canola plastid 90.66 90.89
Bra025031.1-P Field mustard cytosol 87.12 90.79
Bra022023.1-P Field mustard plastid 89.77 90.57
Bra017569.1-P Field mustard plastid 89.77 90.46
CDY35152 Canola plastid 89.77 90.46
KRH11182 Soybean cytosol, plastid 81.31 81.73
KRH58640 Soybean cytosol 79.42 81.16
Solyc02g021470.2.1 Tomato cytosol, nucleus, plastid 80.3 81.02
KRH42547 Soybean cytosol 78.66 81.01
VIT_10s0003g03710.t01 Wine grape cytosol 81.06 80.05
TraesCS5A01G425300.1 Wheat cytosol 71.34 79.47
Solyc02g070460.2.1 Tomato plastid 78.28 77.31
GSMUA_Achr4P22850_001 Banana cytosol 77.15 76.09
KRH21072 Soybean plastid 44.82 73.5
TraesCS5B01G427400.1 Wheat cytosol 74.24 73.23
EER93338 Sorghum plastid 76.52 72.66
Zm00001d034361_P001 Maize cytosol, plastid 76.26 72.6
TraesCS5D01G433700.3 Wheat cytosol, plastid 75.25 71.81
HORVU5Hr1G103580.2 Barley plastid 75.25 71.55
GSMUA_Achr7P01270_001 Banana cytosol 78.16 70.74
Zm00001d013116_P002 Maize plastid 76.39 70.35
AT1G26830.1 Thale cress cytosol 37.63 40.71
AT1G69670.1 Thale cress cytosol 37.5 40.57
AT4G02570.1 Thale cress cytosol 30.18 32.38
AT1G02980.1 Thale cress cytosol 28.16 30.05
AT1G43140.1 Thale cress cytosol 26.77 29.4
AT1G59800.1 Thale cress cytosol 6.44 20.0
AT1G59790.1 Thale cress cytosol 8.59 18.18
Protein Annotations
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UniParc:UPI000005EA80InterPro:WH-like_DNA-bd_sfInterPro:WH_DNA-bd_sfSEG:seg::
Description
CUL4Cullin-4 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8LGH4]
Coordinates
chr5:-:18731371..18736815
Molecular Weight (calculated)
91476.5 Da
IEP (calculated)
8.184
GRAVY (calculated)
-0.454
Length
792 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MSLPTKRSTF SAASASDDSS YSSPPMKKAK NDLHHSPQHP NTADKVVGFH MEEDPTPAAA NLSRKKATLP QPTKKFVIKL NKAKPTLPTN FEENTWEKLQ
101: SAIRAIFLKK KISFDLESLY QAVDNLCLHK LDGKLYDQIE KECEEHISAA LQSLVGQNTD LTVFLSRVEK CWQDFCDQML MIRSIALTLD RKYVIQNPNV
201: RSLWEMGLQL FRKHLSLAPE VEQRTVKGLL SMIEKERLAE AVNRTLLSHL LKMFTALGIY MESFEKPFLE GTSEFYAAEG MKYMQQSDVP EYLKHVEGRL
301: HEENERCILY IDAVTRKPLI TTVERQLLER HILVVLEKGF TTLMDGRRTE DLQRMQTLFS RVNALESLRQ ALSSYVRKTG QKIVMDEEKD KDMVQSLLDF
401: KASLDIIWEE SFYKNESFGN TIKDSFEHLI NLRQNRPAEL IAKFLDEKLR AGNKGTSEEE LESVLEKVLV LFRFIQGKDV FEAFYKKDLA KRLLLGKSAS
501: IDAEKSMISK LKTECGSQFT NKLEGMFKDI ELSKEINESF KQSSQARTKL PSGIEMSVHV LTTGYWPTYP PMDVKLPHEL NVYQDIFKEF YLSKYSGRRL
601: MWQNSLGHCV LKADFSKGKK ELAVSLFQAV VLMLFNDAMK LSFEDIKDST SIEDKELRRT LQSLACGKVR VLQKNPKGRD VEDGDEFEFN DEFAAPLYRI
701: KVNAIQMKET VEENTSTTER VFQDRQYQID AAIVRIMKTR KVLSHTLLIT ELFQQLKFPI KPADLKKRIE SLIDREYLER EKSNPQIYNY LA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.