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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 3
  • mitochondrion 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, nucleus
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:cytosol
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY16196 Canola cytosol 96.45 96.45
CDY50732 Canola cytosol 96.17 96.17
Bra024680.1-P Field mustard cytosol 96.17 96.17
CDY45004 Canola cytosol 95.49 95.49
Bra016291.1-P Field mustard cytosol 95.49 95.49
CDY46437 Canola cytosol 95.36 95.36
AT1G69670.1 Thale cress cytosol 88.11 88.11
PGSC0003DMT400016765 Potato cytosol 84.02 83.79
Solyc01g010820.2.1 Tomato cytosol 83.74 83.52
VIT_01s0026g02230.t01 Wine grape cytosol 83.2 83.08
KRH45896 Soybean cytosol 82.65 82.65
KRG99095 Soybean cytosol 82.51 82.51
EES05529 Sorghum cytosol 79.64 79.21
GSMUA_Achr8P16990_001 Banana cytosol 76.5 79.1
GSMUA_AchrUn_... Banana cytosol 76.37 78.95
GSMUA_Achr7P18000_001 Banana cytosol 76.09 78.67
Os02t0746000-01 Rice cytosol 79.1 78.67
Zm00001d018043_P001 Maize cytosol 79.1 78.67
TraesCS6D01G285800.1 Wheat cytosol 78.96 78.53
TraesCS6A01G306600.1 Wheat cytosol 78.83 78.4
TraesCS6B01G335200.1 Wheat cytosol 78.83 78.4
HORVU6Hr1G075720.2 Barley cytosol 78.14 76.68
GSMUA_AchrUn_... Banana cytosol 61.07 75.13
KRH70713 Soybean cytosol 72.54 73.04
AT5G46210.1 Thale cress cytosol 40.71 37.63
AT4G02570.1 Thale cress cytosol 34.43 34.15
AT1G02980.1 Thale cress cytosol 32.1 31.67
AT1G43140.1 Thale cress cytosol 30.46 30.93
AT1G59800.1 Thale cress cytosol 8.74 25.1
AT1G59790.1 Thale cress cytosol 11.61 22.73
Protein Annotations
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Description
CUL3ACUL3A [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178WM88]
Coordinates
chr1:+:9295565..9298629
Molecular Weight (calculated)
85317.9 Da
IEP (calculated)
8.022
GRAVY (calculated)
-0.535
Length
732 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MSNQKKRNFQ IEAFKHRVVV DPKYADKTWQ ILERAIHQIY NQDASGLSFE ELYRNAYNMV LHKFGEKLYT GFIATMTSHL KEKSKLIEAA QGGSFLEELN
101: KKWNEHNKAL EMIRDILMYM DRTYIESTKK THVHPMGLNL WRDNVVHFTK IHTRLLNTLL DLVQKERIGE VIDRGLMRNV IKMFMDLGES VYQEDFEKPF
201: LDASSEFYKV ESQEFIESCD CGDYLKKSEK RLTEEIERVA HYLDAKSEEK ITSVVEKEMI ANHMQRLVHM ENSGLVNMLL NDKYEDLGRM YNLFRRVTNG
301: LVTVRDVMTS HLREMGKQLV TDPEKSKDPV EFVQRLLDER DKYDKIINTA FGNDKTFQNA LNSSFEYFIN LNARSPEFIS LFVDDKLRKG LKGITDVDVE
401: VILDKVMMLF RYLQEKDVFE KYYKQHLAKR LLSGKTVSDD AERSLIVKLK TECGYQFTSK LEGMFTDMKT SEDTMRGFYG SHPELSEGPT LIVQVLTTGS
501: WPTQPAVPCN LPAEVSVLCE KFRSYYLGTH TGRRLSWQTN MGTADIKAIF GKGQKHELNV STFQMCVLML FNNSDRLSYK EIEQATEIPA ADLKRCLQSL
601: ACVKGKNVIK KEPMSKDIGE EDLFVVNDKF TSKFYKVKIG TVVAQKETEP EKQETRQRVE EDRKPQIEAA IVRIMKSRKI LDHNNIIAEV TKQLQPRFLA
701: NPTEIKKRIE SLIERDFLER DSTDRKLYRY LA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.