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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: cytosol

Predictor Summary:
  • nucleus 1
  • cytosol 2
  • plastid 2
  • mitochondrion 2
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:cytosol
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, nucleus, plastid
BaCelLo:nucleus
MultiLoc:cytosol
Plant-mPloc:plastid
PProwler:mitochondrion
TargetP:mitochondrion
WoLF PSORT:plastid
YLoc:cytosol
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY32235 Canola cytosol 94.92 95.23
Os03t0328000-01 Rice plasma membrane 14.43 93.95
CDY34451 Canola endoplasmic reticulum 93.22 90.36
GSMUA_Achr10P... Banana extracellular 48.52 83.69
Solyc08g016050.2.1 Tomato nucleus 41.2 83.22
Bra038448.1-P Field mustard cytosol 94.04 83.06
VIT_11s0016g00100.t01 Wine grape mitochondrion 83.11 82.35
Solyc08g016060.1.1 Tomato extracellular 12.79 82.11
KRH43411 Soybean endoplasmic reticulum 79.62 79.4
KRH13046 Soybean endoplasmic reticulum 79.45 79.24
KXG39465 Sorghum cytosol 76.01 75.64
HORVU4Hr1G051250.3 Barley cytosol 75.41 75.25
TraesCS4A01G131100.1 Wheat cytosol 75.36 75.15
TraesCS4B01G173500.4 Wheat cytosol 75.3 75.1
TraesCS4D01G175600.4 Wheat cytosol 75.14 74.93
Zm00001d047540_P001 Maize cytosol, mitochondrion 75.19 74.54
Zm00001d029004_P004 Maize cytosol 75.46 74.05
Solyc08g016070.1.1 Tomato mitochondrion 22.08 65.8
GSMUA_Achr10P... Banana cytosol 28.52 64.6
Zm00001d024153_P001 Maize cytosol 4.97 59.87
Zm00001d012342_P001 Maize cytosol, endoplasmic reticulum, extracellular, golgi, nucleus, plasma membrane, plastid, vacuole 6.78 53.45
Zm00001d035539_P001 Maize cytosol 5.96 53.17
Zm00001d042645_P001 Maize cytosol, nucleus, peroxisome 13.39 41.74
TraesCS5A01G195400.1 Wheat cytosol 2.68 36.03
TraesCS5D01G127700.1 Wheat cytosol 2.79 35.66
Zm00001d007384_P003 Maize cytosol, endoplasmic reticulum, peroxisome 6.34 32.4
Zm00001d035534_P003 Maize cytosol 7.27 28.12
Zm00001d046856_P002 Maize endoplasmic reticulum, nucleus, peroxisome 7.98 27.39
Zm00001d038664_P001 Maize cytosol, nucleus, plastid 7.32 25.05
Protein Annotations
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PO:PO:0025281PFscan:PS51650PFscan:PS51651PANTHER:PTHR23317PANTHER:PTHR23317:SF76UniProt:Q8SAB7
Symbol:SPK1UniParc:UPI00000A496DSEG:seg:::
Description
SPK1Guanine nucleotide exchange factor SPIKE 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8SAB7]
Coordinates
chr4:-:9228185..9241629
Molecular Weight (calculated)
206840.0 Da
IEP (calculated)
6.105
GRAVY (calculated)
-0.246
Length
1830 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MENNNLGLRF RKLPRQPLAL PKLDPLLDEN LEQWPHLNQL VQCYGTEWVK DVNKYGHYEN IRPDSFQTQI FEGPDTDTET EIRLASARSA TIEEDVASIS
0101: GRPFSDPGSS KHFGQPPLPA YEPAFDWENE RAMIFGQRTP ESPAASYSSG LKISVRVLSL AFQSGLVEPF FGSIALYNQE RKEKLSEDFY FQIQPTEMQD
0201: AKLSSENRGV FYLDAPSASV CLLIQLEKTA TEEGGVTSSV YSRKEPVHLT EREKQKLQVW SRIMPYRESF AWAVVPLFDN NLTTNTGESA SPSSPLAPSM
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0401: LTLMKCPSSS SGGPRNGCSK WNSEDAKDVS RNLTSSCGTP DLNCYHAFDF CSTTRNEPFL HLFHCLYVYP VAVTLSRKRN PFIRVELRKD DTDIRKQPLE
0501: AIYPREPGVS LQKWVHTQVA VGARAASYHD EIKVSLPATW TPSHHLLFTF FHVDLQTKLE APRPVVVGYA SLPLSTYIHS RSDISLPVMR ELVPHYLQES
0601: TKERLDYLED GKNIFKLRLR LCSSLYPTNE RVRDFCLEYD RHTLQTRPPW GSELLQAINS LKHVDSTALL QFLYPILNML LHLIGNGGET LQVAAFRAMV
0701: DILTRVQQVS FDDADRNRFL VTYVDYSFDD FGGNQPPVYP GLATVWGSLA RSKAKGYRVG PVYDDVLSMA WFFLELIVKS MALEQARLYD HNLPTGEDVP
0801: PMQLKESVFR CIMQLFDCLL TEVHERCKKG LSLAKRLNSS LAFFCYDLLY IIEPCQVYEL VSLYMDKFSG VCQSVLHECK LTFLQIISDH DLFVEMPGRD
0901: PSDRNYLSSI LIQELFLSLD HDELPLRAKG ARILVILLCK HEFDARYQKA EDKLYIAQLY FPFVGQILDE MPVFYNLNAT EKREVLIGVL QIVRNLDDTS
1001: LVKAWQQSIA RTRLYFKLME ECLILFEHKK AADSILGGNN SRGPVSEGAG SPKYSERLSP AINNYLSEAS RQEVRLEGTP DNGYLWQRVN SQLASPSQPY
1101: SLREALAQAQ SSRIGASAQA LRESLHPILR QKLELWEENV SATVSLQVLE ITENFSSMAA SHNIATDYGK LDCITTILTS FFSRNQSLAF WKAFFPIFNR
1201: IFDLHGATLM ARENDRFLKQ IAFHLLRLAV YRNDSVRKRA VIGLQILVKS SLYFMQTARL RALLTITLSE LMSDVQVTHM KSDNTLEESG EARRLQQSLS
1301: EMADEAKSVN LLRECGLPDD TLLIIPEKFT ENRWSWAEVK HLSDSLVLAL DASLGHALLG SVMAMDRYAA AESFYKLGMA FAPVPDLHIM WLLHLCDAHQ
1401: EMQSWAEAAQ CAVAVAGVIM QALVARNDGV WSKDHVSALR KICPMVSGEF TTEASAAEVE GYGASKLTVD SAVKYLQLAN KLFSQAELYH FCASILELVI
1501: PVYKSRKAYG QLAKCHTLLT NIYESILDQE SNPIPFIDAT YYRVGFYGEK FGKLDRKEYV YREPRDVRLG DIMEKLSHIY ESRMDSNHIL HIIPDSRQVK
1601: AEDLQAGVCY LQITAVDAVM EDEDLGSRRE RIFSLSTGSV RARVFDRFLF DTPFTKNGKT QGGLEDQWKR RTVLQTEGSF PALVNRLLVT KSESLEFSPV
1701: ENAIGMIETR TTALRNELEE PRSSDGDHLP RLQSLQRILQ GSVAVQVNSG VLSVCTAFLS GEPATRLRSQ ELQQLIAALL EFMAVCKRAI RVHFRLIGEE
1801: DQEFHTQLVN GFQSLTAELS HYIPAILSEL
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.