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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: peroxisome

Predictor Summary:
  • cytosol 1
  • peroxisome 2
  • extracellular 1
  • golgi 1
  • plasma membrane 2
  • endoplasmic reticulum 1
  • vacuole 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY30294 Canola peroxisome 98.0 98.0
CDX82608 Canola peroxisome 97.89 97.89
CDY64741 Canola peroxisome 97.89 97.89
Bra038835.1-P Field mustard cytosol, peroxisome, plasma membrane 97.58 97.58
Bra024452.1-P Field mustard cytosol, peroxisome, plasma membrane 91.68 91.68
AT4G30190.2 Thale cress peroxisome 94.42 91.34
PGSC0003DMT400010497 Potato cytosol, peroxisome, plasma membrane 89.15 88.87
AT5G57350.1 Thale cress peroxisome 87.78 87.78
CDY56511 Canola peroxisome 82.93 87.74
CDY62140 Canola peroxisome 63.22 87.46
EES11577 Sorghum cytosol, peroxisome, plasma membrane 86.3 86.12
Os04t0656100-01 Rice plasma membrane 85.25 85.07
TraesCS2B01G530500.1 Wheat peroxisome 84.09 83.91
TraesCS2D01G503000.1 Wheat golgi, plastid, unclear 84.09 83.91
CDY45897 Canola extracellular 8.11 83.7
TraesCS2A01G502400.1 Wheat golgi 83.67 83.49
VIT_19s0090g00010.t01 Wine grape mitochondrion 6.11 82.86
CDY62141 Canola cytosol, endoplasmic reticulum, plasma membrane 19.81 82.82
AT1G80660.1 Thale cress peroxisome 82.82 82.39
AT2G07560.1 Thale cress peroxisome 81.77 81.77
AT3G42640.1 Thale cress peroxisome 81.56 81.65
KRH16408 Soybean cytosol, extracellular, plasma membrane 15.91 80.32
AT5G62670.1 Thale cress peroxisome 80.61 80.02
CDY14177 Canola extracellular 21.18 79.76
AT3G47950.1 Thale cress peroxisome 79.66 78.75
HORVU2Hr1G111640.2 Barley plasma membrane 83.77 78.71
AT2G24520.2 Thale cress plasma membrane 81.66 77.97
AT3G60330.4 Thale cress cytosol, peroxisome, plasma membrane 73.97 73.05
AT1G17260.1 Thale cress peroxisome 70.18 70.33
AT4G11730.1 Thale cress peroxisome 56.06 65.44
GSMUA_Achr7P19560_001 Banana nucleus 15.7 59.6
VIT_02s0012g00950.t01 Wine grape plastid 13.91 56.17
Zm00001d027407_P003 Maize cytosol 7.17 53.54
Solyc02g011700.1.1 Tomato extracellular 5.37 45.95
Zm00001d027603_P001 Maize plasma membrane 15.6 40.77
VIT_01s0011g01030.t01 Wine grape peroxisome, plasma membrane, plastid 22.66 37.99
Zm00001d045237_P004 Maize cytosol 4.95 34.81
Zm00001d013197_P002 Maize plastid 17.91 30.14
Zm00001d033487_P001 Maize plastid 17.6 29.2
Protein Annotations
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Description
AHA1Plasma membrane ATPase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178VSN5]
Coordinates
chr2:+:8221514..8227622
Molecular Weight (calculated)
104230.0 Da
IEP (calculated)
6.667
GRAVY (calculated)
0.077
Length
949 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MSGLEDIKNE TVDLEKIPIE EVFQQLKCTR EGLTTQEGED RIVIFGPNKL EEKKESKILK FLGFMWNPLS WVMEAAALMA IALANGDNRP PDWQDFVGII
101: CLLVINSTIS FIEENNAGNA AAALMAGLAP KTKVLRDGKW SEQEAAILVP GDIVSIKLGD IIPADARLLE GDPLKVDQSA LTGESLPVTK HPGQEVFSGS
201: TCKQGEIEAV VIATGVHTFF GKAAHLVDST NQVGHFQKVL TSIGNFCICS IAIGIAIEIV VMYPIQHRKY RDGIDNLLVL LIGGIPIAMP TVLSVTMAIG
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401: NPVDKRTALT YIDSDGNWHR VSKGAPEQIL DLANARPDLR KKVLSCIDKY AERGLRSLAV ARQVVPEKTK ESPGGPWEFV GLLPLFDPPR HDSAETIRRA
501: LNLGVNVKMI TGDQLAIGKE TGRRLGMGTN MYPSAALLGT DKDSNIASIP VEELIEKADG FAGVFPEHKY EIVKKLQERK HIVGMTGDGV NDAPALKKAD
601: IGIAVADATD AARGASDIVL TEPGLSVIIS AVLTSRAIFQ RMKNYTIYAV SITIRIVFGF MLIALIWEFD FSAFMVLIIA ILNDGTIMTI SKDRVKPSPT
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801: IAVYADWTFA KVKGIGWGWA GVIWIYSIVT YFPQDILKFA IRYILSGKAW ASLFDNRTAF TTKKDYGIGE REAQWAQAQR TLHGLQPKED VNIFPEKGSY
901: RELSEIAEQA KRRAEIARLR ELHTLKGHVE SVAKLKGLDI DTAGHHYTV
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.