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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion

Predictor Summary:
  • mitochondrion 7
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:mitochondrion
Any Predictor:mitochondrion
BaCelLo:mitochondrion
MultiLoc:mitochondrion
Predotar:mitochondrion
PProwler:mitochondrion
TargetP:mitochondrion
WoLF PSORT:mitochondrion
YLoc:mitochondrion
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
AT4G33010.1 Thale cress mitochondrion 89.46 90.07
Os01t0711400-01 Rice mitochondrion 27.3 88.51
Os06t0611900-01 Rice mitochondrion 42.62 87.77
PGSC0003DMT400076966 Potato mitochondrion 84.0 84.73
Solyc08g065220.2.1 Tomato plastid 83.52 84.17
KRH05459 Soybean mitochondrion 84.29 83.33
KRH15534 Soybean mitochondrion 84.2 83.0
KRH52197 Soybean mitochondrion 80.75 82.4
GSMUA_Achr3P26310_001 Banana mitochondrion 77.87 82.37
VIT_11s0016g02280.t01 Wine grape mitochondrion 78.35 82.29
KRH61504 Soybean mitochondrion 81.23 82.25
EES15687 Sorghum mitochondrion 81.03 81.19
TraesCS3A01G250200.1 Wheat mitochondrion 80.17 81.18
TraesCS3B01G279700.1 Wheat plastid 80.17 81.18
TraesCS3D01G250600.1 Wheat mitochondrion 79.89 80.89
Zm00001d023437_P001 Maize mitochondrion 79.79 79.94
GSMUA_Achr1P14430_001 Banana mitochondrion 74.04 79.12
VIT_04s0008g01300.t01 Wine grape mitochondrion 79.12 77.41
HORVU3Hr1G051040.1 Barley mitochondrion, peroxisome 6.32 75.86
KRH05426 Soybean peroxisome 25.96 74.86
GSMUA_Achr8P05620_001 Banana cytosol 5.27 51.4
Protein Annotations
KEGG:00260+1.4.4.2MapMan:1.3.4.1Gene3D:3.40.640.10Gene3D:3.90.1150.10EntrezGene:817149ProteinID:AAC31228.1
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InterPro:GcvPInterPro:IPR015421InterPro:IPR015422HAMAP:MF_00711RefSeq:NP_180178.1UniProt:O80988
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PO:PO:0025195PO:PO:0025281PANTHER:PTHR11773InterPro:PyrdxlP-dep_TrfaseInterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_dom1InterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_major
SUPFAM:SSF53383TIGRFAMs:TIGR00461UniParc:UPI000012B348SEG:seg::
Description
GLDP2Glycine dehydrogenase (decarboxylating) 2, mitochondrial [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O80988]
Coordinates
chr2:-:11109003..11114291
Molecular Weight (calculated)
113782.0 Da
IEP (calculated)
6.633
GRAVY (calculated)
-0.183
Length
1044 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MERARRLAYR GIVKRLVNET KRHRNGESSL LPTTTVTPSR YVSSVSSFLH RRRDVSGSAF TTSGRNQHQT RSISVDALKP SDTFPRRHNS ATPDEQAQMA
0101: NYCGFDNLNT LIDSTVPKSI RLDSMKFSGI FDEGLTESQM IEHMSDLASK NKVFKSFIGM GYYNTHVPPV ILRNIMENPA WYTQYTPYQA EISQGRLESL
0201: LNYQTVITDL TGLPMSNASL LDEGTAAAEA MAMCNNILKG KKKTFVIASN CHPQTIDVCK TRADGFDLKV VTVDIKDVDY SSGDVCGVLV QYPGTEGEVL
0301: DYGEFVKNAH ANGVKVVMAT DLLALTMLKP PGEFGADIVV GSGQRFGVPM GYGGPHAAFL ATSQEYKRMM PGRIIGVSVD SSGKQALRMA MQTREQHIRR
0401: DKATSNICTA QALLANMTAM YAVYHGPEGL KSIAQRVHGL AGVFALGLKK LGTAQVQDLP FFDTVKVTCS DATAIFDVAA KKEINLRLVD SNTITVAFDE
0501: TTTLDDVDKL FEVFASGKPV QFTAESLAPE FNNAIPSSLT RESPYLTHPI FNMYHTEHEL LRYIHKLQNK DLSLCHSMIP LGSCTMKLNA TTEMMPVTWP
0601: SFTNMHPFAP VEQAQGYQEM FTNLGELLCT ITGFDSFSLQ PNAGAAGEYA GLMVIRAYHM SRGDHHRNVC IIPVSAHGTN PASAAMCGMK IVAVGTDAKG
0701: NINIEELRNA AEANKDNLAA LMVTYPSTHG VYEEGIDEIC NIIHENGGQV YMDGANMNAQ VGLTSPGFIG ADVCHLNLHK TFCIPHGGGG PGMGPIGVKQ
0801: HLAPFLPSHP VIPTGGIPEP EQTSPLGTIS AAPWGSALIL PISYTYIAMM GSGGLTDASK IAILNANYMA KRLESHYPVL FRGVNGTVAH EFIIDLRGFK
0901: NTAGIEPEDV AKRLMDYGFH GPTMSWPVPG TLMIEPTESE SKAELDRFCD ALISIREEIS QIEKGNADPN NNVLKGAPHP PSLLMADTWK KPYSREYAAF
1001: PAPWLRSSKF WPTTGRVDNV YGDRNLVCTL QPANEEQAAA AVSA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.