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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion

Predictor Summary:
  • mitochondrion 7
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:mitochondrion
Any Predictor:mitochondrion
BaCelLo:mitochondrion
MultiLoc:mitochondrion
Predotar:mitochondrion
PProwler:mitochondrion
TargetP:mitochondrion
WoLF PSORT:mitochondrion
YLoc:mitochondrion
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX75316 Canola mitochondrion 90.26 89.66
Bra011405.1-P Field mustard mitochondrion 90.26 89.57
CDX68930 Canola mitochondrion 90.26 89.57
AT2G26080.1 Thale cress mitochondrion 90.07 89.46
Os01t0711400-01 Rice mitochondrion 27.48 88.51
Os06t0611900-01 Rice mitochondrion 42.72 87.38
PGSC0003DMT400076966 Potato mitochondrion 85.63 85.8
Solyc08g065220.2.1 Tomato plastid 83.8 83.88
KRH05459 Soybean mitochondrion 84.57 83.05
KRH52197 Soybean mitochondrion 81.58 82.7
KRH15534 Soybean mitochondrion 84.28 82.53
KRH61504 Soybean mitochondrion 81.77 82.25
GSMUA_Achr3P26310_001 Banana mitochondrion 77.82 81.76
VIT_11s0016g02280.t01 Wine grape mitochondrion 77.82 81.19
TraesCS3B01G279700.1 Wheat plastid 80.62 81.09
TraesCS3A01G250200.1 Wheat mitochondrion 80.42 80.89
TraesCS3D01G250600.1 Wheat mitochondrion 80.33 80.8
EES15687 Sorghum mitochondrion 80.81 80.42
Zm00001d023437_P001 Maize mitochondrion 79.94 79.56
GSMUA_Achr1P14430_001 Banana mitochondrion 74.35 78.92
VIT_04s0008g01300.t01 Wine grape mitochondrion 80.91 78.63
KRH05426 Soybean peroxisome 25.94 74.31
HORVU3Hr1G051040.1 Barley mitochondrion, peroxisome 6.17 73.56
GSMUA_Achr8P05620_001 Banana cytosol 5.3 51.4
Protein Annotations
KEGG:00260+1.4.4.2MapMan:1.3.4.1Gene3D:3.40.640.10Gene3D:3.90.1150.10EntrezGene:829438UniProt:A0A178UTF1
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EMBL:AY128922Unigene:At.22214Symbol:AtGLDP1EMBL:BT000446EMBL:BT001132ProteinID:CAA21210.1
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InterPro:PyrdxlP-dep_TrfaseInterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_dom1InterPro:PyrdxlP-dep_Trfase_majorUniProt:Q94B78SUPFAM:SSF53383TIGRFAMs:TIGR00461
UniParc:UPI00000A2D8BSEG:seg::::
Description
GLDP1Glycine cleavage system P protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UTF1]
Coordinates
chr4:-:15926652..15931422
Molecular Weight (calculated)
112932.0 Da
IEP (calculated)
6.981
GRAVY (calculated)
-0.141
Length
1037 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MERARRLAYR GIVKRLVNDT KRHRNAETPH LVPHAPARYV SSLSPFISTP RSVNHTAAFG RHQQTRSISV DAVKPSDTFP RRHNSATPDE QTHMAKFCGF
0101: DHIDSLIDAT VPKSIRLDSM KFSKFDAGLT ESQMIQHMVD LASKNKVFKS FIGMGYYNTH VPTVILRNIM ENPAWYTQYT PYQAEISQGR LESLLNFQTV
0201: ITDLTGLPMS NASLLDEGTA AAEAMAMCNN ILKGKKKTFV IASNCHPQTI DVCKTRADGF DLKVVTSDLK DIDYSSGDVC GVLVQYPGTE GEVLDYAEFV
0301: KNAHANGVKV VMATDLLALT VLKPPGEFGA DIVVGSAQRF GVPMGYGGPH AAFLATSQEY KRMMPGRIIG ISVDSSGKQA LRMAMQTREQ HIRRDKATSN
0401: ICTAQALLAN MAAMYAVYHG PAGLKSIAQR VHGLAGIFSL GLNKLGVAEV QELPFFDTVK IKCSDAHAIA DAASKSEINL RVVDSTTITA SFDETTTLDD
0501: VDKLFKVFAS GKPVPFTAES LAPEVQNSIP SSLTRESPYL THPIFNMYHT EHELLRYIHK LQSKDLSLCH SMIPLGSCTM KLNATTEMMP VTWPSFTDIH
0601: PFAPVEQAQG YQEMFENLGD LLCTITGFDS FSLQPNAGAA GEYAGLMVIR AYHMSRGDHH RNVCIIPVSA HGTNPASAAM CGMKIITVGT DAKGNINIEE
0701: VRKAAEANKD NLAALMVTYP STHGVYEEGI DEICNIIHEN GGQVYMDGAN MNAQVGLTSP GFIGADVCHL NLHKTFCIPH GGGGPGMGPI GVKNHLAPFL
0801: PSHPVIPTGG IPQPEKTAPL GAISAAPWGS ALILPISYTY IAMMGSGGLT DASKIAILNA NYMAKRLEKH YPVLFRGVNG TVAHEFIIDL RGFKNTAGIE
0901: PEDVAKRLMD YGFHGPTMSW PVPGTLMIEP TESESKAELD RFCDALISIR EEIAQIEKGN ADVQNNVLKG APHPPSLLMA DTWKKPYSRE YAAFPAPWLR
1001: SSKFWPTTGR VDNVYGDRKL VCTLLPEEEQ VAAAVSA
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.