Subcellular Localization
min:
: max
Winner_takes_all: plastid
Predictor Summary:
Predictor Summary:
- plastid 9
PPI
No PPI Data
Homology
Paralog
| locus | Identity | Homology Identity |
|---|
Ortholog
| locus | Homology Species | Location | Identity | Homology Identity |
|---|---|---|---|---|
| Bra034394.1-P | Field mustard | plastid | 73.61 | 76.81 |
| CDY30502 | Canola | plastid | 73.61 | 76.44 |
| CDX77163 | Canola | plastid | 69.91 | 74.38 |
| TraesCS7B01G197300.1 | Wheat | golgi | 65.74 | 70.65 |
| TraesCS7A01G292100.1 | Wheat | plastid | 65.74 | 70.65 |
| EES15166 | Sorghum | plastid | 67.13 | 70.39 |
| TraesCS7D01G290700.2 | Wheat | plastid | 65.74 | 70.3 |
| Zm00001d031908_P001 | Maize | plastid | 66.2 | 69.42 |
| Os08t0561700-01 | Rice | extracellular | 67.59 | 69.19 |
| KRH26536 | Soybean | plastid | 57.87 | 68.31 |
| PGSC0003DMT400001102 | Potato | plastid | 67.13 | 67.44 |
| GSMUA_Achr10P... | Banana | plastid | 67.13 | 67.13 |
| Solyc11g066390.1.1 | Tomato | extracellular, plastid | 67.13 | 66.82 |
| VIT_06s0061g00750.t01 | Wine grape | extracellular, plastid | 64.35 | 65.57 |
| AT1G08830.1 | Thale cress | cytosol | 44.91 | 63.82 |
| GSMUA_Achr9P20410_001 | Banana | plastid | 64.35 | 60.7 |
| Bra011971.1-P | Field mustard | plastid | 54.17 | 57.64 |
| HORVU7Hr1G060130.2 | Barley | plastid, vacuole | 67.13 | 56.64 |
| AT5G18100.1 | Thale cress | peroxisome | 40.28 | 53.05 |
Protein Annotations
| MapMan:10.2.2.3 | Gene3D:2.60.40.200 | EntrezGene:817365 | UniProt:A0A178VRV1 | ProteinID:AAM15088.1 | ProteinID:AEC08089.1 |
| EMBL:AF061519 | EMBL:AK227096 | ArrayExpress:AT2G28190 | EnsemblPlantsGene:AT2G28190 | RefSeq:AT2G28190 | TAIR:AT2G28190 |
| RefSeq:AT2G28190-TAIR-G | EnsemblPlants:AT2G28190.1 | TAIR:AT2G28190.1 | EMBL:AY064050 | EMBL:AY087944 | EMBL:AY133756 |
| Unigene:At.20409 | ProteinID:CAB51839.1 | ProteinID:CAB51840.1 | Symbol:CSD2 | GO:GO:0003674 | GO:GO:0003824 |
| GO:GO:0004784 | GO:GO:0005488 | GO:GO:0005507 | GO:GO:0005575 | GO:GO:0005576 | GO:GO:0005615 |
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| GO:GO:0006979 | GO:GO:0008150 | GO:GO:0008152 | GO:GO:0008270 | GO:GO:0009058 | GO:GO:0009507 |
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| RefSeq:NP_565666.1 | UniProt:O78310 | ProteinID:OAP08508.1 | PFAM:PF00080 | PO:PO:0000013 | PO:PO:0000014 |
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| PO:PO:0020100 | PO:PO:0020137 | PO:PO:0025022 | PO:PO:0025195 | PO:PO:0025281 | PRINTS:PR00068 |
| ScanProsite:PS00087 | ScanProsite:PS00332 | PANTHER:PTHR10003 | PANTHER:PTHR10003:SF34 | InterPro:SOD-like_Cu/Zn_dom_sf | InterPro:SOD_Cu/Zn_/chaperone |
| InterPro:SOD_Cu/Zn_BS | InterPro:SOD_Cu_Zn_dom | SUPFAM:SSF49329 | UniParc:UPI00000017E2 | SEG:seg | : |
Description
CSD2Superoxide dismutase [Cu-Zn] 2, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O78310]
Coordinates
chr2:+:12014412..12016569
Molecular Weight (calculated)
22245.3 Da
IEP (calculated)
7.015
GRAVY (calculated)
-0.110
Length
216 amino acids
Sequence
(BLAST)
(BLAST)
001: MAATNTILAF SSPSRLLIPP SSNPSTLRSS FRGVSLNNNN LHRLQSVSFA VKAPSKALTV VSAAKKAVAV LKGTSDVEGV VTLTQDDSGP TTVNVRITGL
101: TPGPHGFHLH EFGDTTNGCI STGPHFNPNN MTHGAPEDEC RHAGDLGNIN ANADGVAETT IVDNQIPLTG PNSVVGRAFV VHELKDDLGK GGHELSLTTG
201: NAGGRLACGV IGLTPL
101: TPGPHGFHLH EFGDTTNGCI STGPHFNPNN MTHGAPEDEC RHAGDLGNIN ANADGVAETT IVDNQIPLTG PNSVVGRAFV VHELKDDLGK GGHELSLTTG
201: NAGGRLACGV IGLTPL
Hydropathy Plot
About CropPAL
The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.