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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: mitochondrion

Predictor Summary:
  • plastid 1
  • mitochondrion 7
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY51151 Canola mitochondrion 92.26 92.26
Bra037347.1-P Field mustard mitochondrion 89.13 92.16
CDY07209 Canola mitochondrion 92.42 92.12
CDY68746 Canola mitochondrion 91.76 92.07
CDX74340 Canola mitochondrion 91.76 91.61
Bra000967.1-P Field mustard mitochondrion 91.27 89.35
VIT_15s0046g03670.t01 Wine grape mitochondrion 81.38 81.65
KRH48207 Soybean mitochondrion 81.22 81.62
KRH65116 Soybean mitochondrion 80.89 81.29
KRH00689 Soybean mitochondrion 78.25 79.17
KRH40505 Soybean mitochondrion 77.76 78.54
Solyc01g094200.2.1 Tomato plastid 77.43 78.2
PGSC0003DMT400000066 Potato mitochondrion 77.1 74.64
GSMUA_Achr1P00210_001 Banana mitochondrion 74.14 74.5
Os10t0503500-01 Rice mitochondrion 74.79 73.23
KXG38219 Sorghum mitochondrion 74.14 72.82
TraesCS1D01G164800.4 Wheat mitochondrion, unclear 73.97 72.77
TraesCS1B01G190400.5 Wheat mitochondrion 72.16 71.34
Zm00001d013911_P001 Maize mitochondrion 71.0 67.34
HORVU1Hr1G045720.1 Barley plastid 74.3 62.04
AT2G13560.1 Thale cress mitochondrion 61.45 59.87
AT5G25880.1 Thale cress cytosol 38.55 39.8
AT2G19900.1 Thale cress cytosol 38.06 39.76
AT5G11670.1 Thale cress cytosol 37.07 38.27
AT1G79750.1 Thale cress plastid 37.56 35.29
Protein Annotations
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UniProt:Q8L7K9SMART:SM00919SMART:SM01274SUPFAM:SSF51735SUPFAM:SSF53223UniParc:UPI00000ABF1A
SEG:seg:::::
Description
NAD-ME2NAD-dependent malic enzyme 2, mitochondrial [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8L7K9]
Coordinates
chr4:-:242461..246804
Molecular Weight (calculated)
66644.6 Da
IEP (calculated)
7.074
GRAVY (calculated)
-0.092
Length
607 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MMWKNIAGLS KAAAAARTHG SRRCFSTAIP GPCIVHKRGA DILHDPWFNK DTGFPLTERD RLGIRGLLPP RVMTCVQQCD RFIESFRSLE NNTKGEPENV
101: VALAKWRMLN RLHDRNETLY YRVLIDNIKD FAPIIYTPTV GLVCQNYSGL YRRPRGMYFS AKDKGEMMSM IYNWPAPQVD MIVITDGSRI LGLGDLGVQG
201: IGIPIGKLDM YVAAAGINPQ RVLPIMLDVG TNNEKLLQND LYLGVRQPRL EGEEYLEIID EFMEAAFTRW PKAVVQFEDF QAKWAFGTLE RYRKKFCMFN
301: DDVQGTAGVA LAGLLGTVRA QGRPISDFVN QKIVVVGAGS AGLGVTKMAV QAVARMAGIS ESEATKNFYL IDKDGLVTTE RTKLDPGAVL FAKNPAEIRE
401: GASIVEVVKK VRPHVLLGLS GVGGIFNEEV LKAMRESDSC KPAIFAMSNP TLNAECTAAD AFKHAGGNIV FASGSPFENV ELENGKVGHV NQANNMYLFP
501: GIGLGTLLSG ARIVTDGMLQ AASECLASYM TDEEVQKGIL YPSINNIRHI TAEVGAAVLR AAVTDDIAEG HGDVGPKDLS HMSKEDTVNY ITRNMWFPVY
601: SPLVHEK
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.