Skip to main content
crop-pal logo
Wheat
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: nucleus

Predictor Summary:
  • nucleus 3
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
TraesCS7A01G203600.1 Wheat nucleus 97.06 96.4
TraesCS7B01G110600.1 Wheat nucleus 96.29 95.86
HORVU7Hr1G041450.33 Barley nucleus 69.26 93.21
GSMUA_Achr6P02430_001 Banana cytosol 15.27 56.92
KRH02187 Soybean nucleus 22.36 54.45
Zm00001d037346_P007 Maize nucleus 52.9 46.73
OQU76185 Sorghum nucleus 55.42 46.11
CDY14410 Canola nucleus 28.63 38.51
Solyc11g062010.1.1 Tomato nucleus 29.28 36.97
CDY07678 Canola nucleus 29.58 36.24
TraesCS1D01G089200.2 Wheat nucleus 10.63 31.49
Bra000114.1-P Field mustard nucleus 30.23 31.08
TraesCS7D01G069700.1 Wheat cytosol 7.19 31.07
TraesCS4D01G053600.2 Wheat cytosol 7.43 29.94
TraesCS2D01G365000.1 Wheat cytosol 7.28 29.84
KRH50934 Soybean nucleus 32.7 29.06
AT2G28290.5 Thale cress nucleus 29.61 27.89
TraesCS1D01G099600.1 Wheat nucleus 9.06 27.55
TraesCS3D01G068900.1 Wheat nucleus 8.91 26.76
TraesCS2D01G400400.1 Wheat cytosol 6.33 24.23
TraesCS4D01G364600.1 Wheat cytosol, mitochondrion 6.27 23.92
TraesCS3D01G403600.1 Wheat nucleus 7.81 21.42
VIT_05s0020g02020.t01 Wine grape nucleus 16.72 21.05
TraesCS2D01G130900.1 Wheat nucleus 9.65 18.81
TraesCS7D01G148900.4 Wheat nucleus 7.69 18.43
TraesCS6D01G039800.1 Wheat nucleus, plastid 11.85 18.03
TraesCS4D01G159900.1 Wheat nucleus 7.75 17.47
TraesCS2D01G234200.1 Wheat nucleus 10.31 15.44
TraesCS7D01G531100.1 Wheat nucleus 8.91 13.82
Protein Annotations
MapMan:12.4.1.1.3Gene3D:3.40.50.10810Gene3D:3.40.50.300ncoils:CoilGO:GO:0000166GO:GO:0003674
GO:GO:0005488GO:GO:0005515GO:GO:0005524GO:GO:0042393InterPro:HSA_domInterPro:Helicase_ATP-bd
InterPro:Helicase_CInterPro:IPR001650InterPro:IPR014001InterPro:IPR014012InterPro:IPR038718InterPro:P-loop_NTPase
PFAM:PF00176PFAM:PF00271PFAM:PF14619PFscan:PS51192PFscan:PS51194PFscan:PS51204
PANTHER:PTHR10799PANTHER:PTHR10799:SF926SMART:SM00487SMART:SM00490SMART:SM01314InterPro:SNF2-like_sf
InterPro:SNF2_NSUPFAM:SSF52540InterPro:SnACEnsemblPlantsGene:TraesCS7D01G206700EnsemblPlants:TraesCS7D01G206700.2TIGR:cd00046
TIGR:cd00079SEG:seg::::
Description
No Description!
Coordinates
chr7D:+:164183920..164205382
Molecular Weight (calculated)
363146.0 Da
IEP (calculated)
5.113
GRAVY (calculated)
-0.640
Length
3367 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MASSQHVEVE AAKLLQKLIL ESKDEPAKLA TKLYVICQHM KLSGKEQSLP YQVISRAMET VVSQHGIDMD ALRSSRVPFA GGPQAVDSSG VMSKDKEIIG
0101: GQSSMVGSDA SQSSGQAALW HLPPGSADMA RPGVYIPGRV PAGQNRGDVA GSDIHQGSMS QKSGRSSGVE SPASLQMEDT RSMNSHDSLK SDEKTSKKAS
0201: SSKRKRMDSK AAGDMQSEEN SKSDGISSGQ NIRKRKQVGK AGAQGQPSRG AEPEQSHILQ GATAQVPPLP GGASFFRAHQ EGPPASAGRT IDNTKPSNPF
0301: AMSQVSNFAE GLASGSIPTE LQKSILGGTN MFNTGFGWNQ SSQGSAIKNT QGSVANLMRP GVNVEGKINV GSQGAFNPTP TSQMDFPKIP PYMSSSFGGG
0401: SQFLDKGKDS ASGNTGTELH SAAKVGVNMG IVHGSPMQER QNITRAPQRA ESSLQEARLS SLPNRNVGPY QTSHISPNTP FKEQQLKQLR AQCLVFLAFR
0501: NNMQPRKVHL EIALGGGPTA EGGGAGQGGN ESRVADGSVR ENGNSQENSA IFGSQSDMSR LPSTSAGSIA EADSSLKDSE IKKKINIAEH EKSSMEIENI
0601: QQAVMQGTGS SSEMRSQEIA SPVPSGPQQS YFQGDKRRNA PETYRTDAEN LNRNLGFGGQ GPSSLGGNRQ HPNFEAAVLT KDRLQDEASK ESYPPSRLHH
0701: MPIDGYSSNL PGKDLTPDTD RNEVEHCTQM GEMSDRSADE GDDDLFEHDD FASTPPKYTM TEKWIIDYQK RKYGENEKKV LEQQSAHKRM SASYQKLKES
0801: VSSSEDLTAK TKSVIELKKL QLLSLQRRVR SEFLSDFFKP NTADLERVKA VKKHRHGRRV KQLEKIEQKM KEERQKRIRE RQKEFFADIE SHRERLEDSF
0901: KAKRERLKGF NRYIKEFHKR KERIHREKLD RIQREKINLL KNNDVEGYLR MVQDAKSDRV KQLLRETEKY LQKLGAKLRG DSSMDGRSYV SGKGVTANDV
1001: EDESYQPQNY LESNEKYYQL AHSVKEIVND QPTYLNGGKL REYQMNGLRW LVSLYNNNLN GILADEMGLG KTVQVISLLC YLMETKNDRG PFLVVVPSSV
1101: LSGWVSELNF WAPSINKIAY FGPPEERRRL FKEMIVQQKF NVLLTTYEYL MNKHDRPKLS KIQWHYIIID EGHRIKNASC KLNADLKLYR SSHRLLLTGT
1201: PLQNNLEELW ALLNFLLPNI FNSSEDFSQW FNKPFESNGD NSADEALLSE EENLLIINRL HQVLRPFVLR RLKHKVESEL PGKIERLVRC EASAYQKLLM
1301: TRVEDNLGGI GAVKVRSVHN SVMELRNICN HPYLSQLHVE EIEGHLPRHY LPSIVRLCGK LEMLDRLLPK LKATGHRVLL FSTMTRLLDV MEDYLVWKKY
1401: QYLRLDGHTS GHERGALIDR FNDPDSPAFI FLLSIRAGGV GVNLQAADTV IIFDTDWNPQ VDLQAQARAH RIGQKKEVLV LRLETVRTVE EQVRASAEHK
1501: LGVANQSITA GFFDNNTSAE DRREYLESLL RECKKEESAP VLDDDALNNI LARSEDEIDI FESIDKQRLD DEMAVWLKVV QDGSVSGLDP SVLPPRLVSD
1601: DDLKPFCHAM KIYESSNVKN VKVNVRKKGE LGGLDTKHYG RGKRAREVRS YEDQWTEEEF EKLCQAESPD SPQPGGVLKD IDISKESKLE VPAESSIDPK
1701: ESSIDPVEAK TVPVLAVPDS SPPVPSVPDS SPAKRRRGRP RRSDVSVSPV MSPAKAVQQE AGTTLGSSAP ASTIDSAAPT ATIHSTGPDV TTHSAAPVAA
1801: IKPDIGTEVK ATAFVAAVPT ATMKPEIGTE VTDHVVLEGS IAKEVGPAVE SGHDPVAASA APHPPAPATS RGRKTQAVET PRRRGRKPKS LFSSSAGDIN
1901: INPVVAIGSG PASVGSPYPQ GDMPASLMSR FQKDLVTGRP VTSLPEGVKG ISAPESTTPV AEDKHTGTAI SSDNANLLMP KIIHNENVGF VQASSEQVFS
2001: ASVPTLTAVS GGILKASHIL LADKPAEKQS ASRRRRKKAP GGEDTGVSTR QRAAMKKSDG IPGTNDNVGA DMSTAEKLGA VNVKDGSSLQ DTPKELPNIN
2101: SPPYDKSGYD SQPRTPIAVP ISEAALPSGS GNAHVAYSDI TPRIPTNPDG QDKPVNLHIG APLAAASQPQ VPCKTGNDHV AVCSVVTTTH SETVTEKPLL
2201: NPVSELANVQ VEPPSSSLNS GKNISTVPSE VNSVAPSKAS GRRRKGPASE PRTRSKAATA ACERRARLAG PKQTGDARKL EILASPSTAV CVSSVEQQET
2301: ALAEPPTASV CEPQKNAESH VRGGMSTPMG ILDAPKQIAT QSITACTEET NSSLSTQTPA LPISRESNLS MGDKQGVGVY TIHGQTKMVL AAELASANDE
2401: HKLHEVHDKT ADGNILQHSA ANDTLQDKTD SIAGLDLASR HRIGDLEMEK GDSNTVMLPD CQTPFDASVK DIKDTLAPTE ADVSDLQSEA AAIDVTSPKQ
2501: DTMVVEALHT NSGGSASHLP AALQSTDSNQ HAERKGSSEN SGSKFFASGK KTEEMEGTLD KNTDNNLIQA NADIALGRHS PSEDKREDSC AHVVDGGLLG
2601: SKQTLLEVVS AVNTDGSEEA LNASSTHSNK DATSVCEVTK DPESHVRVSV LASAAMNARD DCEEVHNVPS THSDRGGSMV EVDASRDDAT SICEVCKDPE
2701: SNVSGELSMP VGLAELELEL PNQSKSSSQS SAVNADETKA SINIQTTSLV ESGEQKSPRN GAHELKEGME LAGPKIECTI LMPSPDDKSS EAHSLAQREM
2801: VSGAEQASMK DDKRNKMVDV TFSSGEEQEI QRADVDLPTC PRYADCEGEK DHSPKTILAG SQSFCEASDK DVAPVKDDHT DPQSEVNVVD MNGANQDSAE
2901: TEAMQIDGVS KGSSSDLPAA LRSTDSNQPA EQDGLENSPS ISACPKEHEK LEETSDEIGG GNSNRSRTDG DSHIMNLVGY SEDSDEDNSI QVADVGDVGS
3001: KETTHDGISA VPRGAEPGDG PCTEPTCETA VHVHEFNVDV AISEDGHGTM ALGSVQASTT ELKDLESGRC LEHGTGTPVA LQEGTAVAAE PEAKKEVDEP
3101: KDVEPAAIKP EAVEHDGTEA DPSKEASIPP QEETTAVALV TGPEQNEEAD APTQVKPVAV IPGTGPEEKK VEASTQEDNA EAVAAEPESA RAQENAEAST
3201: QPSPMEIESV QETAMLGEAE TRQQLPLPSA EGVVAEASEP PSIEVAAMKE PELLSTEPAP DGENAKLGEA EAEQLLQQPS SCEAMAVTGE LPSAVGAKTD
3301: GTSDVAADES PAVVGEEVLN TETAPDGENP RPSEADTAQS PHLPEEGKAV AATEPANLEK AEANDGK
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT2G28290.4 )
(BLAST)
0001: MTSSSHNIEL EAAKFLHKLI QDSKDEPAKL ATKLYVILQH MKTSGKENTM PYQVISRAMD TVVNQHGLDI EALKSSCLPH PGGTQTEDSG SAHLAGSSQA
0101: VGVSNEGKAT LVENEMTKYD AFTSGRQLGG SNSASQTFYQ GSGTQSNRSF DRESPSNLDS TSGISQPHNR SETMNQRDVK SSGKRKRGES SLSWDQNMDN
0201: SQIFDSHKID DQTGEVSKIE MPGNSGDIRN LHVGLSSDAF TTPQCGWQSS EATAIRPAIH KEPGNNVAGE GFLPSGSPFR EQQLKQLRAQ CLVFLALRNG
0301: LVPKKLHVEI ALRNTFREED GFRGELFDPK GRTHTSSDLG GIPDVSALLS RTDNPTGRLD EMDFSSKETE RSRLGEKSFA NTVFSDGQKL LASRIPSSQA
0401: QTQVAVSHSQ LTFSPGLTKN TPSEMVGWTG VIKTNDLSTS AVQLDEFHSS DEEEGNLQPS PKYTMSQKWI MGRQNKRLLV DRSWSLKQQK ADQAIGSRFN
0501: ELKESVSLSD DISAKTKSVI ELKKLQLLNL QRRLRSEFVY NFFKPIATDV EHLKSYKKHK HGRRIKQLEK YEQKMKEERQ RRIRERQKEF FGGLEVHKEK
0601: LEDLFKVRRE RLKGFNRYAK EFHKRKERLH REKIDKIQRE KINLLKINDV EGYLRMVQDA KSDRVKQLLK ETEKYLQKLG SKLKEAKLLT SRFENEADET
0701: RTSNATDDET LIENEDESDQ AKHYLESNEK YYLMAHSIKE NINEQPSSLV GGKLREYQMN GLRWLVSLYN NHLNGILADE MGLGKTVQVI SLICYLMETK
0801: NDRGPFLVVV PSSVLPGWQS EINFWAPSIH KIVYCGTPDE RRKLFKEQIV HQKFNVLLTT YEYLMNKHDR PKLSKIHWHY IIIDEGHRIK NASCKLNADL
0901: KHYVSSHRLL LTGTPLQNNL EELWALLNFL LPNIFNSSED FSQWFNKPFQ SNGESSAEEA LLSEEENLLI INRLHQVLRP FVLRRLKHKV ENELPEKIER
1001: LIRCEASAYQ KLLMKRVEDN LGSIGNAKSR AVHNSVMELR NICNHPYLSQ LHSEEVNNII PKHFLPPIVR LCGKLEMLDR MLPKLKATDH RVLFFSTMTR
1101: LLDVMEDYLT LKGYKYLRLD GQTSGGDRGA LIDGFNKSGS PFFIFLLSIR AGGVGVNLQA ADTVILFDTD WNPQVDLQAQ ARAHRIGQKK DVLVLRFETV
1201: NSVEEQVRAS AEHKLGVANQ SITAGFFDNN TSAEDRKEYL ESLLRESKKE EDAPVLDDDA LNDLIARRES EIDIFESIDK QRKENEMETW NTLVHGPGSD
1301: SFAHIPSIPS RLVTEDDLKL LYETMKLNDV PMVAKESTVG MKRKDGSMGG LDTHQYGRGK RAREVRSYEE KLTEEEFEKL CQTESPDSPQ GKGEGSERSL
1401: ANDTSNIPVE NSSDTLLPTS PTQAITVQPM EPVRPQSHTL KEETQPIKRG RGRPKRTDKA LTPVSLSAVS RTQATGNAIS SAATGLDFVS SDKRLEAASH
1501: PTSSLALTSP DLSGPPGFQS LPASPAPTPI RGRGRGRSRG RGAGRGRRVE GVLHGSNSSI TQRTETATSL ASDAEATKFA LPRSASEIVS RVPKANEGST
1601: SNPDQVSPVH SATTALRSDK AADKDLDAPP GFDSGSHVQT LNVLENSSER KAFAVKKRPL IQGVSSQHPG PNKQPLDLPV STSSTLLGGG PVQNQNAVSS
1701: VCDGSKSPSE GRTYTALQGV TTAPSDATLP MSSQPSDATL PMSSQPVGST VEAQEANVPS LPAALPAKRR VRNLPSRGET PKRQGKRRGQ PLPATDASSA
1801: RSTGLTPQIE VKVGNLSGTK AKFDAVAKEQ PHFSQSVAPD IHSSGSLSQE IRRDTSGTGG SARKQTADVT DVARVMKEIF SETSLLKHKV GEPSATTRTN
1901: VPDAQSPGEM NLHTVETHKA EDSSGLKNQE ALYNLSKADK LVSDIPHPVP GDLTTSGSVA NKDVDIGSSK VAAENELVKI PGGDVDSSVI QLSLGNTLTA
2001: KSSLEKCTAD QLLGEKLSQE GETTPASDGE TCHLAEETAS SLSYVRSEPT ASASTTAEPL PTDKLEKNIS FQDEVKTLNG DKREAILLSS EEQTNVNSKI
2101: ETNSEELQAS RTDEVPHVDG KSVDVANQTV KEDEAKHSVE IQSSMLEPDE LPNAGQKGHS SIDLQPLVLV TSNENAMSLD DKDYDPISKS ADIEQDPEES
2201: VFVQGVGRPK VGTADTQMED TNDAKLLVGC SVESEEKEKT LQSLIPGDDA DTEQDPEESV SDQRPKVGSA YTQMEDTDEA KLLMGCSVES EEKEKTLQSH
2301: IPGDDADTEK NPEESVSVQG VDRPKVGTTD TQMEDTNDAK LLVGCSVASE EKEKTLQSHI PGDDADTEQN PEESVSVQGV NRPKVGNANT QMEDTDEAKV
2401: LVGCSVESEE KEKTLQSHIP GDDADTEQNP EESVSNFDRP KDGTADTHME DIDDAKLLVG CSVESEEKEK SLQSHMPSDD AVLHAPFENT KDSKGDDLHG
2501: ESLVSCPTME VMEQKGFESE THARTDSGGI DRGNEVSENM SDGVKMNISS VQVPDASHDL NVSQDQTDIP LVGGIDPEHV QENVDVPASP HGAAPNIVIF
2601: QSEGHLSPSI LPDDVAGQLE SMSNDEKTNI SSEQVPDVSH DLKVSQDQTD IPPVGGIVPE NLQEIVDVPA SPHGVVPDVV VSQSEEIQSP SILPDDVPGQ
2701: PDDGNCEKMD TMQNNTSIDI GITSGKTCQP SSSTQPEDEN RNSLSHCEPS EVVEQRDSRD QVCIGSVESQ VEISSAILEN RSADIQPPQS ILVDQKDIEE
2801: SKEPGIESAD VSLHQLADIQ AEPSNLVDQM DIEESKEPGT ESADVSLHQL ADIQPGPSIL VDQMDTEKSK EPGTESADVS LHQLADIQPG PSILVDQMDT
2901: EKSKEPGTES ADVSLHQLAD IQPGPSILVD QMDTEEFKNP DVSLHQLADI EPSLSISAVQ KNIEDKDQSH VETAGSELVD VSAECSTEPQ VQLPPSSEPV
3001: GDMHVHLGAS KSEIVAEGTD FSSSLPKTEE ENAKSQLADT EPSSSLTAVQ KNIEDQVETA GCEFVVVSTG CSTEPQVQLP PSAEPVVAEG TEFPSSLLMT
3101: GVDNSSHLMT GVDNAKTHLA DVVPSSSPTT MEKNIEAQDQ DQVTTGGCGL VDVLTECSSE PQLQLPPSAE PVISEGTELA TLPLTEEENA DSQLANIEPS
3201: SSPSVVEKNI EAQDQDQVKT AGCELVSTGC SSEPQVHLPP SAEPDGDIHV HLKETEKSES MVVVGEGTAF PSSLPVTEEG NAESQLADTE PFTSPTVVEK
3301: NIKDQEQVET TGCGLVDDST GCSSEPQVQL PPSAEPMEVV QTNIEDQDQI ETGGCDLINV PSGCSTEPQI QLSSSAEPEE GMHIHLEAAM NSETVVTEGS
3401: ELPSSLPMTE DENADGQLAE VEPSVSLTVE QTNIEEKDHI ETAECELVDV SPGCSSQPEV KFPPSPDAVG GMDVHLETVV TEDTDSNSSL PKTEEKDAEN
3501: PSDRLDGESD GTTVATVEGT CVESNSLVAE ESNIEVPKDN EDV
Arabidopsis Description
SYDP-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A1P8B2X1]
SUBAcon: [nucleus]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.