Skip to main content
crop-pal logo
Canola
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: nucleus

Predictor Summary:
  • nucleus 4
  • mitochondrion 1
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDY07678 Canola nucleus 85.42 77.8
Bra000114.1-P Field mustard nucleus 95.53 73.01
GSMUA_Achr6P02430_001 Banana cytosol 21.05 58.36
KRH02187 Soybean nucleus 31.04 56.18
AT2G28290.5 Thale cress nucleus 64.0 44.81
CDY47176 Canola cytosol 8.35 44.09
Solyc11g062010.1.1 Tomato nucleus 40.67 38.17
HORVU7Hr1G041450.33 Barley nucleus 37.75 37.77
CDY57125 Canola cytosol 10.07 32.9
CDX81370 Canola cytosol 10.03 32.77
CDY53848 Canola cytosol 10.07 32.68
CDY30755 Canola cytosol 10.03 32.43
CDY18840 Canola nucleus 13.9 32.13
CDX92595 Canola nucleus 10.79 30.2
KRH50934 Soybean nucleus 45.15 29.82
TraesCS7D01G206700.2 Wheat nucleus 38.51 28.63
TraesCS7B01G110600.1 Wheat nucleus 38.47 28.47
TraesCS7A01G203600.1 Wheat nucleus 38.35 28.32
CDY18857 Canola nucleus 11.47 27.36
CDY13907 Canola nucleus 11.39 26.91
CDY24695 Canola nucleus 11.31 26.88
CDY04120 Canola cytosol 8.11 26.71
CDY02609 Canola nucleus 11.19 26.54
CDY48619 Canola nucleus, plastid 8.07 26.41
Zm00001d037346_P007 Maize nucleus 38.31 25.16
CDY05261 Canola endoplasmic reticulum, extracellular, golgi, nucleus, plasma membrane, vacuole 11.39 25.15
OQU76185 Sorghum nucleus 39.83 24.64
CDX74702 Canola cytosol 8.55 24.6
CDY18960 Canola cytosol 8.51 24.51
CDX75208 Canola cytosol 10.19 21.32
CDX68802 Canola cytosol 10.31 21.25
VIT_05s0020g02020.t01 Wine grape nucleus 21.81 20.42
CDY56279 Canola cytosol 9.95 18.54
CDX81444 Canola nucleus 12.27 18.13
CDX76767 Canola cytosol, nucleus, plastid 9.91 18.02
CDY37209 Canola nucleus 12.11 17.97
CDY67658 Canola cytosol, nucleus 7.95 17.63
CDY30994 Canola nucleus 4.39 17.19
CDY27338 Canola nucleus, plastid 14.06 16.73
CDX83383 Canola nucleus, plastid 14.14 16.58
CDY37083 Canola plastid 13.94 16.55
CDY68094 Canola nucleus 8.11 16.28
CDX72050 Canola cytosol 9.55 16.23
CDX95673 Canola cytosol 6.23 15.85
CDX88940 Canola nucleus 10.23 15.48
CDY08401 Canola nucleus 11.95 14.91
CDY52874 Canola nucleus 11.95 14.82
CDX95672 Canola plastid 5.51 12.78
CDY06115 Canola nucleus 9.51 12.64
CDY71637 Canola nucleus 2.32 7.84
Protein Annotations
MapMan:12.4.1.1.3Gene3D:3.40.50.10810Gene3D:3.40.50.300GO:A0A078FIZ2UniProt:A0A078FIZ2EnsemblPlants:CDY14410
ProteinID:CDY14410ProteinID:CDY14410.1ncoils:CoilGO:GO:0000166GO:GO:0003674GO:GO:0005488
GO:GO:0005515GO:GO:0005524GO:GO:0005575GO:GO:0005622GO:GO:0005623GO:GO:0005634
GO:GO:0006139GO:GO:0006355GO:GO:0008150GO:GO:0008152GO:GO:0009058GO:GO:0009987
GO:GO:0042393EnsemblPlantsGene:GSBRNA2T00079068001InterPro:Gln-Leu-Gln_QLQInterPro:HSA_domInterPro:Helicase_ATP-bdInterPro:Helicase_C
InterPro:IPR001650InterPro:IPR014001InterPro:IPR014012InterPro:IPR014978InterPro:IPR038718InterPro:P-loop_NTPase
PFAM:PF00176PFAM:PF00271PFAM:PF14619PFscan:PS51192PFscan:PS51194PFscan:PS51204
PANTHER:PTHR10799PANTHER:PTHR10799:SF926SMART:SM00487SMART:SM00490SMART:SM00951SMART:SM01314
InterPro:SNF2-like_sfInterPro:SNF2_NSUPFAM:SSF52540InterPro:SnACUniParc:UPI0004EF169ESEG:seg
Description
BnaC03g21850DBnaC03g21850D protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A078FIZ2]
Coordinates
chrLK032043:+:122608..137197
Molecular Weight (calculated)
275236.0 Da
IEP (calculated)
5.390
GRAVY (calculated)
-0.695
Length
2503 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MSSSSSHNIE LEAAKFLHKL IQDSKDEPSK LATKLYVILQ HMKTSGKEHS MPYQVISRAM ETVVSQHGLD IEALTSPRLP HAGGSSTQME DSGSAHIAGS
0101: SQVVGVNNEP KASLVENEMS KYDAFTSARQ LGGSTSASQA VYQGPGTRSN RSFDHDSPSS LDSKPGNAQS HDRNETMNQR DAKSGAKRKR GESSFSWDQN
0201: MDNSQQFDTH GTVDDQTRKM SKVEMPATGD AENLHVGLSS DAYTTPQGGW QNSEITAIRP PAHRDTGKSV AAEDVPPSGQ LFKEQQLKQL RAQCLVFLAL
0301: RNGLMPKKLH IDIALGNVFP KDDGFRRELL DQKGRTHSLS ESGSIVEVSA PSARMDNPTG RLAEMDFSSK ETAIPRLEDK ISNAIFPDGQ KLLLASNTPD
0401: APAQNQVSGS HSELASSSGG VTKHAPVEMV GWTGTINRND ASTFTFESDE LCAPDQEEGN MLPPPKYTMS QKWIMDRQNK RLLVDRSWGL KQQKADQAIG
0501: ARFNELKESV TSSEDISTKT KSVIELKKLQ LLSLQRRLRS EFLHNFFKPI ANDVENLKSY KKHKHGRRIR QLEKYEQKMK EERQRRIRER QKEFFGEIEV
0601: HKERLDDLSK ARRERWKGFN RYVKEFHKRK ERFHREKIDK IQREKINLLK INDVEGYLRM VQDAKSDRVM QLLKETEKYL QKLGSKLKEA KSLASRFENE
0701: ADEAPVEDKT HYLESNEKYY LMAHSIKENI SEQPASLKGG KLREYQMNGL RWLLSLYNNH LNGILADEMG LGKTVQVISL ICYLMDTKND RGPFLVVVPS
0801: SVLPGWVSEI NFWAPTIQKI VYCGPPEERR KLFKEQIVNQ KFNVLLTTYE YLMNKHDRPK LSKILWHYII IDEGHRIKNA SCKLNADLKH YNSSHRLLLT
0901: GTPLQNNLEE LWALLNFLLP NIFNSSEDFS QWFNKPFQSN GDNSAEEALL SEEENLLIIN RLHQVLRPFV LRRLKHKVEN ELPEKIERLI RCEASAYQKL
1001: LMKRVEDNLG SLGNMKSRAV HNSVMELRNI CNHPYLSQLH TEEVNSLIPE HYLPPVIRLC GKLEMLDRLL PKLKATDHRV LFFSTMTRLL DVMEDYLTFK
1101: GYKYLRLDGH TSGGDRGALI DGFNKSDSPY FIFLLSIRAG GVGVNLQAAD TVIIFDTDWN PQVDLQAQAR AHRIGQKRDV LVLRFETVNT VEEQVRASAE
1201: HKLGVANQSI TAGFFDNNTS AEDRKEYLES LLRESKKEEA APVLDDDALN DIIARRESEI DIFESIDNQR KEDEMETWKS LVQGSGSKSS APIPPIPSRL
1301: VTEDDLKLLY EAMKMNNVPM VAVEPNVGMK RKGGSVGGLD TQQYGRGKRA REVRSYEEQL TEEEFEKMCQ TESTDSPRGK EEESEKNLAN ATSNILGGNI
1401: GETMLPTSTA LALTPQPVEP LQKSQQPLKE VTEPVKRGRG RPKRADKTPN QLSASVPGRT HATGDTRSSP VIGSDVASGS LTSPDLSVPP GFQPLPASNS
1501: SPMPTRGRGR GRGRGRGAGR GRRVENILQG ADSSIGTQRT NARASLSGDP VASNLVTLPV SSVAIDAKVP KPIKGSSSNL ESGPSIHSDT TAVQPSPAVS
1601: LQESSLLDAP PGFGSGSHVQ PLNVSEDSLV KKAASLKNKP AVPDVRNNQG SGVQKQPVNM PSSTALAPGQ SQTTPLNANQ PPLNANQPPL NANQPLSPHL
1701: VGSTVEAASV LSPPAPMPVK RQGRKTPNRG ETPRRRGRRH VQASPAADGS SARSTILTPQ TEVKVGDSSG SKITSVGNKS DVVVQEQPHF NPSLAHSSAG
1801: TSQEKRKEIS GVGGTGRKQT TDVTDVARVM KEIFSETSLL KHKVGEPSET TVTNEPDGKS PETMNMHIAK TSKAENIIQP ADHNLRVEAT SSNVTAEKQN
1901: TEVPENLNDS VTKSCLEMSV SISEKVVENE LLTANSDDLK CAEMISGGHT SNCPPNTSTE EALADQIVTE ETSYAGNDLV KISGVEADSS VVQLSSGDIL
2001: SSVASLTTTE PLPTEQQVTN LSTEGKGEEI DGDKKGTTPL IPVEQMNVQP TVGSHVLERS YEESQRSPMR IDESSYVDSK SLDTTNQTSE EDEAKRKEGE
2101: SPDDQICDVG PSSAAIQLSM PHTDGLKTQT SNKNSISLVH EDYGSPLSDS ANAEQDSGES ASILGGDSCK LGGEASTADT EMVDASVQLP FSAEQVGVGT
2201: DSPSSLPVIE GDKAENPSDE RNIVAGEASG INVSIQPEDL CMNLGETEEP AQMGTVGDAS DRAEDDMAID AENPSDERNM IDINPSVQPE DLSRTLGETE
2301: GPAQMGEVGD ASDHSEDNVA VSVLGEKEES NDQREHLSSE LSSGEETKAE NPSDEKNMID GEASGMNASV QPEDMSRSLI ETEEPAQMGK VGSAGDHSEN
2401: VAVSVLGEKE ESQDQQEHLS IALSSEEENK AENPSDDRDM IHGEASGKKV PVQPEDLPMN LVETEEPTQV GELVMQATCL KITLAYWRKK KNQRINGSLC
2501: LQH
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT2G28290.2 )
(BLAST)
0001: MTSSSHNIEL EAAKFLHKLI QDSKDEPAKL ATKLYVILQH MKTSGKENTM PYQVISRAMD TVVNQHGLDI EALKSSCLPH PGGTQTEDSG SAHLAGSSQA
0101: VGVSNEGKAT LVENEMTKYD AFTSGRQLGG SNSASQTFYQ GSGTQSNRSF DRESPSNLDS TSGISQPHNR SETMNQRDVK SSGKRKRGES SLSWDQNMDN
0201: SQIFDSHKID DQTGEVSKIE MPGNSGDIRN LHVGLSSDAF TTPQCGWQSS EATAIRPAIH KEPGNNVAGE GFLPSGSPFR EQQLKQLRAQ CLVFLALRNG
0301: LVPKKLHVEI ALRNTFREED GFRGELFDPK GRTHTSSDLG GIPDVSALLS RTDNPTGRLD EMDFSSKETE RSRLGEKSFA NTVFSDGQKL LASRIPSSQA
0401: QTQVAVSHSQ LTFSPGLTKN TPSEMVGWTG VIKTNDLSTS AVQLDEFHSS DEEEGNLQPS PKYTMSQKWI MGRQNKRLLV DRSWSLKQQK ADQAIGSRFN
0501: ELKESVSLSD DISAKTKSVI ELKKLQLLNL QRRLRSEFVY NFFKPIATDV EHLKSYKKHK HGRRIKQLEK YEQKMKEERQ RRIRERQKEF FGGLEVHKEK
0601: LEDLFKVRRE RLKGFNRYAK EFHKRKERLH REKIDKIQRE KINLLKINDV EGYLRMVQDA KSDRVKQLLK ETEKYLQKLG SKLKEAKLLT SRFENEADET
0701: RTSNATDDET LIENEDESDQ AKHYLESNEK YYLMAHSIKE NINEQPSSLV GGKLREYQMN GLRWLVSLYN NHLNGILADE MGLGKTVQVI SLICYLMETK
0801: NDRGPFLVVV PSSVLPGWQS EINFWAPSIH KIVYCGTPDE RRKLFKEQIV HQKFNVLLTT YEYLMNKHDR PKLSKIHWHY IIIDEGHRIK NASCKLNADL
0901: KHYVSSHRLL LTGTPLQNNL EELWALLNFL LPNIFNSSED FSQWFNKPFQ SNGESSAEEA LLSEEENLLI INRLHQVLRP FVLRRLKHKV ENELPEKIER
1001: LIRCEASAYQ KLLMKRVEDN LGSIGNAKSR AVHNSVMELR NICNHPYLSQ LHSEEVNNII PKHFLPPIVR LCGKLEMLDR MLPKLKATDH RVLFFSTMTR
1101: LLDVMEDYLT LKGYKYLRLD GQTSGGDRGA LIDGFNKSGS PFFIFLLSIR AGGVGVNLQA ADTVILFDTD WNPQVDLQAQ ARAHRIGQKK DVLVLRFETV
1201: NSVEEQVRAS AEHKLGVANQ SITAGFFDNN TSAEDRKEYL ESLLRESKKE EDAPVLDDDA LNDLIARRES EIDIFESIDK QRKENEMETW NTLVHGPGSD
1301: SFAHIPSIPS RLVTEDDLKL LYETMKLNDV PMVAKESTVG MKRKDGSMGG LDTHQYGRGK RAREVRSYEE KLTEEEFEKL CQTESPDSPQ GKGEGSERSL
1401: ANDTSNIPVE NSSDTLLPTS PTQAITVQPM EPVRPQSHTL KEETQPIKRG RGRPKRTDKA LTPVSLSAVS RTQATGNAIS SAATGLDFVS SDKRLEAASH
1501: PTSSLALTSP DLSGPPGFQS LPASPAPTPI RGRGRGRSRG RGAGRGRRVE GVLHGSNSSI TQRTETATSL ASDAEATKFA LPRSASEIVS RVPKANEGST
1601: SNPDQVSPVH SATTALRSDK AADKDLDAPP GFDSGSHVQT LNVLENSSER KAFAVKKRPL IQGVSSQHPG PNKQPLDLPV STSSTLLGGG PVQNQNAVSS
1701: VCDGSKSPSE GRTYTALQGV TTAPSDATLP MSSQPSDATL PMSSQPVGST VEAQEANVPS LPAALPAKRR VRNLPSRGET PKRQGKRRGQ PLPATDASSA
1801: RSTGLTPQIE VKVGNLSGTK AKFDAVAKEQ PHFSQSVAPD IHSSGSLSQE IRRDTSGTGG SARKQTADVT DVARVMKEIF SETSLLKHKV GEPSATTRTN
1901: VPDAQSPGEM NLHTVETHKA EDSSGLKNQE ALYNLSKADK LVSDIPHPVP GDLTTSGSVA NKDVDIGSSK VAAENELVKI PGGDVDSSVI QLSLGNTLTA
2001: KSSLEKCTAD QLLGEKLSQE GETTPASDGE TCHLAEETAS SLSYVRSEPT ASASTTAEPL PTDKLEKNIS FQDEVKTLNG DKREAILLSS EEQTNVNSKI
2101: ETNSEELQAS RTDEVPHVDG KSVDVANQTV KEDEAKHSVE IQSSMLEPDE LPNAGQKGHS SIDLQPLVLV TSNENAMSLD DKDYDPISKS ADIEQDPEES
2201: VFVQGVGRPK VGTADTQMED TNDAKLLVGC SVESEEKEKT LQSLIPGDDA DTEQDPEESV SDQRPKVGSA YTQMEDTDEA KLLMGCSVES EEKEKTLQSH
2301: IPGDDADTEK NPEESVSVQG VDRPKVGTTD TQMEDTNDAK LLVGCSVASE EKEKTLQSHI PGDDADTEQN PEESVSVQGV NRPKVGNANT QMEDTDEAKV
2401: LVGCSVESEE KEKTLQSHIP GDDADTEQNP EESVSNFDRP KDGTADTHME DIDDAKLLVG CSVESEEKEK SLQSHMPSDD AVLHAPFENT KDSKGDDLHG
2501: ESLVSCPTME VMEQKGFESE THARTDSGGI DRGNEVSENM SDGVKMNISS VQVPDASHDL NVSQDQTDIP LVGGIDPEHV QENVDVPASP HGAAPNIVIF
2601: QSEGHLSPSI LPDDVAGQLE SMSNDEKTNI SSEQVPDVSH DLKVSQDQTD IPPVGGIVPE NLQEIVDVPA SPHGVVPDVV VSQSEEIQSP SILPDDVPGQ
2701: PDDGNCEKMD TMQNNTSIDI GITSGKTCQP SSSTQPEDEN RNSLSHCEPS EVVEQRDSRD QVCIGSVESQ VEISSAILEN RSADIQPPQS ILVDQKDIEE
2801: SKEPGIESAD VSLHQLADIQ AEPSNLVDQM DIEESKEPGT ESADVSLHQL ADIQPGPSIL VDQMDTEKSK EPGTESADVS LHQLADIQPG PSILVDQMDT
2901: EKSKEPGTES ADVSLHQLAD IQPGPSILVD QMDTEEFKNP DVSLHQLADI EPSLSISAVQ KNIEDKDQSH VETAGSELVD VSAECSTEPQ VQLPPSSEPV
3001: GDMHVHLGAS KSEIVAEGTD FSSSLPKTEE ENAKSQLADT EPSSSLTAVQ KNIEDQVETA GCEFVVVSTG CSTEPQVQLP PSAEPVVAEG TEFPSSLLMT
3101: GVDNSSHLMT GVDNAKTHLA DVVPSSSPTT MEKNIEAQDQ DQVTTGGCGL VDVLTECSSE PQLQLPPSAE PVISEGTELA TLPLTEEENA DSQLANIEPS
3201: SSPSVVEKNI EAQDQDQVKT AGCELVSTGC SSEPQVHLPP SAEPDGDIHV HLKETEKSES MVVVGEGTAF PSSLPVTEEG NAESQLADTE PFTSPTVVEK
3301: NIKDQEQVET TGCGLVDDST GCSSEPQVQL PPSAEPMEGG CDLINVPSGC STEPQIQLSS SAEPEEGMHI HLEAAMNSET VVTEGSELPS SLPMTEDENA
3401: DGQLAEVEPS VSLTVEQTNI EEKDHIETAE CELVDVSPGC SSQPEVKFPP SPDAVGGMDV HLETVVTEDT DSNSSLPKTE EKDAENPSDR LDGESDGTTV
3501: ATVEGTCVES NSLVAEESNI EVPKDNEDV
Arabidopsis Description
SYDP-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A1P8B2X1]
SUBAcon: [nucleus]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.