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Thale cress
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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 8
  • nucleus 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:plastid
Any Predictor:nucleus, plastid
BaCelLo:plastid
ChloroP:plastid
iPSORT:plastid
MultiLoc:plastid
Predotar:plastid
PProwler:plastid
TargetP:plastid
WoLF PSORT:plastid
YLoc:nucleus
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
Bra016240.1-P Field mustard plastid 91.12 91.51
CDY38782 Canola plastid 90.86 91.33
CDY11624 Canola plastid 89.07 90.54
VIT_01s0026g01000.t01 Wine grape cytosol 67.21 73.97
Solyc05g006530.2.1 Tomato nucleus 67.21 68.2
PGSC0003DMT400058295 Potato plastid 67.29 68.17
KRH74713 Soybean nucleus 66.87 67.38
Os02t0739000-01 Rice plastid, vacuole 61.4 60.98
TraesCS6D01G291500.1 Wheat plastid 61.23 60.87
GSMUA_Achr8P22600_001 Banana plastid 62.34 60.53
Zm00001d017982_P001 Maize plastid 60.38 60.17
TraesCS6B01G342300.1 Wheat plastid 61.32 59.73
HORVU6Hr1G076860.2 Barley plastid 60.97 59.7
TraesCS6A01G312100.1 Wheat plastid 61.23 59.55
OQU85441 Sorghum plastid 59.78 58.82
AT1G59760.1 Thale cress cytosol, nucleus, plastid 20.92 24.8
AT2G06990.1 Thale cress nucleus 19.81 23.32
AT3G46960.1 Thale cress nucleus 21.35 18.56
AT3G27730.2 Thale cress nucleus 11.96 12.25
AT2G42270.1 Thale cress cytosol 15.37 8.29
AT1G20960.1 Thale cress cytosol 14.77 7.97
AT4G32700.2 Thale cress nucleus 13.83 7.52
AT5G61140.2 Thale cress plastid 13.32 7.23
Protein Annotations
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SMART:SM00490SMART:SM01142SUPFAM:SSF52540InterPro:Ski2_CUniParc:UPI0000163278SEG:seg
Description
ISE2DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:B9DFG3]
Coordinates
chr1:-:26390016..26394196
Molecular Weight (calculated)
132444.0 Da
IEP (calculated)
5.037
GRAVY (calculated)
-0.372
Length
1171 amino acids
Sequence
(BLAST)
0001: MNTLPVVSLT ASSSFKFFHF PSLHRSLSHS PNFSFTKSLI LNPNHLSFKS TLNSLSPSQS QLYEEEDDEE EEEEDEDDDD EAADEYDNIS DEIRNSDDDD
0101: DDEETEFSVD LPTESARERV EFRWQRVEKL RSLVRDFGVE MIDIDELISI YDFRIDKFQR LAIEAFLRGS SVVVSAPTSS GKTLIAEAAA VSTVAKGRRL
0201: FYTTPLKALS NQKFREFRET FGDDNVGLLT GDSAINKDAQ IVIMTTEILR NMLYQSVGMA SSGTGLFHVD AIVLDEVHYL SDISRGTVWE EIVIYCPKEV
0301: QLICLSATVA NPDELAGWIG EIHGKTELVT STRRPVPLTW YFSTKHSLLP LLDEKGINVN RKLSLNYLQL SASEARFRDD DDGYRKRRSK KRGGDTSYNN
0401: LVNVTDYPLS KNEINKIRRS QVPQISDTLW HLQGKNMLPA IWFIFNRRGC DAAVQYVENF QLLDDCEKSE VELALKKFRV LYPDAVRESA EKGLLRGIAA
0501: HHAGCLPLWK SFIEELFQRG LVKVVFATET LAAGINMPAR TAVISSLSKK AGNERIELGP NELYQMAGRA GRRGIDEKGY TVLVQTAFEG AEECCKLVFA
0601: GVKPLVSQFT ASYGMVLNLV AGSKVTRKSS GTEAGKVLQA GRSLEEAKKL VEKSFGNYVS SNVTVAAKQE LAEIDNKIEI LSSEISDEAI DKKSRKLLSA
0701: RDYKEITVLK EELREEKRKR AEQRRRMELE RFLALKPLLK GMEEGNLPFI CLEFKDSEGR EQSVPAVYLG HIDSFQGSKL QKMMSLDESF ALNLIEDELA
0801: ADEPGKPNVK PSYYVALGSD NSWYLFTEKW VRTVYRTGFP NIALALGDAL PREIMKNLLD KADMQWDKLA ESELGSLWRL EGSLETWSWS LNVPVLSSLS
0901: DEDEVLHMSE EYDNAAQKYK EQRSKISRLK KKMSRSEGFR EYKKILENAN LTVEKMKRLK ARSRRLINRL EQIEPSGWKD FMRISNVIHE SRALDINTHL
1001: IFPLGETAAA IRGENELWLA MVLRNKALVD LKPPQLAGVC ASLVSEGIKV RPWRDNNYIY EPSDTVVDMV NFLEDQRSSL IKLQEKHEVM IPCCLDVQFS
1101: GMVEAWASGL SWKEMMMECA MDEGDLARLL RRTIDLLAQI PKLPDIDPVL QRSAAAAADI MDRPPISELA G
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.