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Wine grape
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Wine grape
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: extracellular

Predictor Summary:
  • cytosol 3
  • vacuole 1
  • plasma membrane 1
  • mitochondrion 2
  • plastid 1
Predictors GFP MS/MS Papers
Winner Takes All:extracellular
Any Predictor:cytosol, mitochondrion, plasma membrane, plastid, vacuole
BaCelLo:cytosol
EpiLoc:vacuole
MultiLoc:cytosol
Plant-mPloc:mitochondrion, plasma membrane
PProwler:mitochondrion
WoLF PSORT:plastid
YLoc:cytosol
 extracellular: 27664331
msms PMID: 27664331 doi
P Pérez-Bermúdez, J Blesa, JM Soriano, A Marcilla
Departament de Biologia Vegetal, Facultat de Farmàcia, Universitat de València, Burjassot, Valencia, Spain., Grupo de Ciencias de la Alimentación Basada en la Evidencia y Experimentación (CiAlBEx), Instituto de Ciencias de los Materiales, Parque Científico, Universitat de València, Paterna, Spain; Unidad Mixta de Investigación en Endocrinología, Nutrición y Dietética Clínica, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe-Universitat de València, Valencia, Spain., Unidad Mixta de Investigación en Endocrinología, Nutrición y Dietética Clínica, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe-Universitat de València, Valencia, Spain; Àrea de Parasitologia, Departament de Farmàcia i Tecnologia Farmacèutica i Parasitologia, Universitat de València, Burjassot, Valencia, Spain. Electronic address: antonio.marcilla@uv.es.
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
KRH46991 Soybean nucleus 95.51 95.51
KRH44667 Soybean nucleus 95.35 95.35
VIT_04s0008g02580.t01 Wine grape cytosol 96.47 95.25
Bra003633.1-P Field mustard cytosol 94.22 94.22
CDY57944 Canola cytosol 94.22 94.22
CDX79274 Canola cytosol 94.22 94.22
Bra008385.1-P Field mustard cytosol 88.92 94.22
CDX88489 Canola cytosol 94.06 94.06
CDX87424 Canola cytosol 94.06 94.06
AT1G78900.1 Thale cress cytosol 94.06 94.06
Bra035074.1-P Field mustard cytosol 93.74 93.74
CDY67023 Canola cytosol 75.76 93.1
GSMUA_Achr11P... Banana cytosol 92.3 92.59
GSMUA_Achr9P23040_001 Banana cytosol 92.3 92.59
EES04615 Sorghum cytosol 91.97 92.27
Zm00001d015426_P001 Maize cytosol 74.48 92.25
EER90164 Sorghum cytosol 91.81 92.11
Zm00001d053765_P003 Maize cytosol 91.65 91.95
GSMUA_Achr1P10520_001 Banana plasma membrane 91.65 91.95
Os06t0662000-01 Rice nucleus, plasma membrane 90.85 91.29
TraesCS7A01G489500.1 Wheat plastid 88.76 89.92
TraesCS7D01G475900.2 Wheat cytosol 88.76 89.92
HORVU6Hr1G069640.1 Barley cytosol, mitochondrion 8.51 89.83
Os02t0175400-01 Rice plasma membrane 89.41 89.69
TraesCS7B01G392600.1 Wheat plastid 89.25 82.01
Zm00001d015427_P001 Maize extracellular, plastid 15.09 78.33
HORVU7Hr1G109770.1 Barley cytosol, mitochondrion 84.11 65.09
VIT_06s0009g03730.t01 Wine grape cytosol 5.3 36.67
VIT_03s0038g02760.t01 Wine grape cytosol 19.9 25.41
VIT_18s0001g01020.t01 Wine grape cytosol, extracellular 20.06 24.85
VIT_14s0068g01700.t01 Wine grape cytosol 4.98 24.41
VIT_17s0000g02900.t01 Wine grape mitochondrion 20.71 23.29
VIT_01s0011g04490.t01 Wine grape mitochondrion 20.55 22.98
VIT_00s0332g00060.t01 Wine grape mitochondrion 5.62 15.35
Protein Annotations
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Gene3D:2.40.50.100MapMan:24.1.1.2.1Gene3D:3.40.50.300InterPro:ATP-synth_a_XtnInterPro:ATP_synth_asu-like_sfInterPro:ATPase_F1/V1/A1_a/bsu_N
InterPro:ATPase_F1/V1/A1_a/bsu_N_sfInterPro:ATPase_F1/V1/A1_a/bsu_nucl-bdInterPro:ATPase_F1/V1_b/a_CInterPro:ATPase_V1-cplx_asuInterPro:ATPase_a/bsu_ASProteinID:CBI18438
ProteinID:CBI18438.3UniProt:D7SS06EMBL:FN594972GO:GO:0000166GO:GO:0000325GO:GO:0002020
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Description
No Description!
Coordinates
chr9:+:21769626..21778772
Molecular Weight (calculated)
68726.3 Da
IEP (calculated)
5.018
GRAVY (calculated)
-0.170
Length
623 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MPSVYGARMT TFEDSEKESE YGYVRKVSGP VVVADGMAGA AMYELVRVGH DNLIGEIIRL EGDSATIQVY EETAGLTVND PVLRTHKPLS VELGPGILGN
101: IFDGIQRPLK TIAKISGDVY IPRGVSVPAL DKDILWEFQP KKLGEGDLLT GGDLYATVFE NSLMQHHVAL PPDAMGKITY VAPAGQYSLK DTVLELEFQG
201: VKKQITMLQT WPVRTPRPVA SKLAADTPLL TGQRVLDALF PSVLGGTCAI PGAFGCGKTV ISQALSKYSN SDTVVYVGCG ERGNEMAEVL MDFPQLTMTL
301: PDGREESVMK RTTLVANTSN MPVAAREASI YTGITIAEYF RDMGYNVSMM ADSTSRWAEA LREISGRLAE MPADSGYPAY LAARLASFYE RAGKVKCLGG
401: PERNGSVTIV GAVSPPGGDF SDPVTSATLS IVQVFWGLDK KLAQRKHFPS VNWLISYSKY ATALESFYEQ YDPDFINIRT KAREVLQRED DLNEIVQLVG
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601: VAKFSKLHED LTAGFRNLDD ETR
Best Arabidopsis Sequence Match ( AT1G78900.1 )
(BLAST)
001: MPAFYGGKLT TFEDDEKESE YGYVRKVSGP VVVADGMAGA AMYELVRVGH DNLIGEIIRL EGDSATIQVY EETAGLTVND PVLRTHKPLS VELGPGILGN
101: IFDGIQRPLK TIARISGDVY IPRGVSVPAL DKDCLWEFQP NKFVEGDTIT GGDLYATVFE NTLMNHLVAL PPDAMGKITY IAPAGQYSLK DTVIELEFQG
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601: VEKFKKLYDD LNAGFRALED ETR
Arabidopsis Description
VHA-AVHA-A [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178W720]
SUBAcon: [cytosol]
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.