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Thale cress
Subcellular Localization
min:
: max

 
Winner_takes_all: plastid

Predictor Summary:
  • plastid 9
PPI
No PPI Data
Homology

Paralog

locusIdentityHomology Identity

Ortholog

locusHomology SpeciesLocationIdentityHomology Identity
CDX86093 Canola cytosol 73.59 96.47
CDX82997 Canola cytosol 71.88 94.23
CDX99099 Canola cytosol, plastid 83.99 92.46
Bra018197.1-P Field mustard plastid 91.08 90.52
Bra033806.1-P Field mustard plastid 87.78 88.42
VIT_06s0004g05150.t01 Wine grape plastid 76.28 77.23
KRH10219 Soybean plastid 74.94 77.2
KRH23106 Soybean endoplasmic reticulum 74.94 76.62
Solyc06g076360.2.1 Tomato plastid 74.94 75.49
PGSC0003DMT400078190 Potato plastid 74.82 73.03
HORVU4Hr1G022900.2 Barley mitochondrion 34.23 70.35
AT1G35860.1 Thale cress nucleus 32.64 66.92
TraesCS4D01G119300.1 Wheat cytosol 49.27 66.72
TraesCS4D01G209900.1 Wheat plastid 63.2 63.99
TraesCS4B01G209200.1 Wheat plastid, unclear 63.33 63.95
TraesCS4A01G095300.1 Wheat golgi, plastid 63.2 63.91
AT4G09080.2 Thale cress golgi 31.78 63.88
HORVU4Hr1G060190.1 Barley plastid 63.08 63.63
Bra018196.1-P Field mustard plastid 88.88 60.53
EER95112 Sorghum plastid 62.47 60.12
Zm00001d028586_P001 Maize plastid 62.1 59.62
Zm00001d047828_P001 Maize plasma membrane 61.86 59.32
TraesCS4A01G194000.1 Wheat plastid 54.77 59.1
KXG36538 Sorghum nucleus 54.16 55.72
CDX68401 Canola cytosol 72.13 50.38
Os12t0115950-00 Rice nucleus, plasma membrane 12.22 41.15
AT3G44160.1 Thale cress cytosol 9.54 21.55
AT3G48620.1 Thale cress extracellular 8.31 21.18
AT5G19620.1 Thale cress plastid 15.77 17.62
GSMUA_Achr9P03850_001 Banana nucleus, peroxisome, plastid 3.91 13.73
Protein Annotations
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PANTHER:PTHR12815PANTHER:PTHR12815:SF18UniProt:Q9STE8TIGRFAMs:TIGR00992Symbol:TOC75-IIIUniParc:UPI00000487FD
SEG:seg:::::
Description
TOC75-3Protein TOC75-3, chloroplastic [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9STE8]
Coordinates
chr3:-:17215813..17219411
Molecular Weight (calculated)
89193.9 Da
IEP (calculated)
9.097
GRAVY (calculated)
-0.365
Length
818 amino acids
Sequence
(BLAST)
001: MAAFSVNGQL IPTATSSTAS TSLSSRRKFL SPSSSRLPRI STQSPRVPSI KCSKSLPNRD TETSSKDSLL KNLAKPLAVA SVSSAASFFL FRISNLPSVL
101: TGGGGGGDGN FGGFGGGGGG GDGNDGGFWG KLFSPSPAVA DEEQSPDWDS HGLPANIVVQ LNKLSGFKKY KVSDIMFFDR RRQTTIGTED SFFEMVSIRP
201: GGVYTKAQLQ KELETLATCG MFEKVDLEGK TKPDGTLGVT ISFAESTWQS ADRFRCINVG LMVQSKPIEM DSDMTDKEKL EYYRSLEKDY KRRIDRARPC
301: LLPAPVYGEV MQMLRDQGKV SARLLQRIRD RVQKWYHDEG YACAQVVNFG NLNTKEVVCE VVEGDITQLV IQFQDKLGNV VEGNTQVPVV RRELPKQLRQ
401: GYVFNIEAGK KALSNINSLG LFSNIEVNPR PDEKNEGGII VEIKLKELEQ KSAEVSTEWS IVPGRGGAPT LASFQPGGSV TFEHRNLQGL NRSLMGSVTT
501: SNFLNPQDDL SFKLEYVHPY LDGVYNPRNR TFKTSCFNSR KLSPVFTGGP GVEEVPPIWV DRAGVKANIT ENFTRQSKFT YGLVMEEITT RDESSHIAAN
601: GQRLLPSGGI SADGPPTTLS GTGVDRMAFL QANITRDNTK FVNGAVVGQR TVFQVDQGLG IGSKFPFFNR HQLTMTKFIQ LREVEQGAGK SPPPVLVLHG
701: HYGGCVGDLP SYDAFVLGGP YSVRGYNMGE LGAARNIAEV GAEIRIPVKN THVYAFVEHG NDLGSSKDVK GNPTAVYRRT GQGSSYGAGV KLGLVRAEYA
801: VDHNNGTGAL FFRFGERY
Hydropathy Plot

About CropPAL

The Protein Annotated Locations Database (CropPAL) houses large scale proteomic and GFP localization data from published experimental studies in Soybean (Glycine max), Maize (Zea mays), Wheat (Triticum aestivum), Barley (Hordeum vulgare), Rice (Oryza sativa), Field mustard (Brassica rapa), Canola (Brassica napus), Sorghum (Sorghum bicolor), Potato (Solanum tuberosum), Tomato (Solanum lycopersicum), Banana (Musa acuminata) and Wine grape (Vitis vinifera) as well as precomputed predictions for protein subcellular localizations using protein sequences.